دبیرستان دوره اول (راهنمایی) نیز در سال 1373 هم زمان با مقطع ابتدایی در خیابان جنت شروع به کار کرد.؛ این مقطع تحصیلی نیز تا سال 1385 در این منطقه قرار داشت و بعد از آن به ساختمانی جدید با امکانات بیشتر در خیابان فلاحی نقل مکان کرد. پس از 3 سال که از افتتاح ابتدایی و دبیرستان دوره اول (راهنمایی) مشکوه میگذشت، دبیرستان دوره دوم نیز در سال 1376 در خیابان ملک الشعرا بهار فعالیت خود را آغاز کرد. این مدرسه نیز با توجه به تعداد بالای دانش آموزان و نیاز به مکانی بهتر، در سال 1378 به خیابان فلاحی منتقل شد.
از همان ابتدای کار که مجتمع مشکوه تاسیس شد، پس از فراخوان بانو طاهایی، جمع کثیری از خانواده ها با اعتمادی فراوان، کودکان و نوجوانان خود را به این مجموعه سپردند و در همان آغاز مسیر، استقبال بی نظیری صورت گرفت. در ادامه راه، با توجه به تقاضای بسیاری که والدین داشتند، مجتمع مشکوه در سال 1396 دپارتمان کانون زبان و در سال 1397 مجموعه هنرستان را نیز به مجتمع مشکوه اضافه کرد. هم اکنون این مجتمع با دارا بودن تمامی مقاطع تحصیلی، به روز ترین سیستم های آموزشی و کامل ترین و بهترین کلاس های درسی، تلاش دارد تا فرزندانی با توانمندی های علمی بالا و اعتقادات مذهبی محکم، تحویل جامعه دهد تا بتواند گامی بلند در جهت رشد علمی و معنوی حکومت جمهوری اسلامی ایران برداشته باشد.